生物信息学,生物计算机和 Perl Bioinformatics, Biocomputing And Perl
[ 荷兰 ] Michael Moorhouse [ 爱尔兰 ]Paul Barry
索书号: Q811/4M825/2004/Y
简评
《生物信息学,生物计算机和 Perl 》介绍了现代生物 信息学所需的计算机技能及应用。该书分为以下四个部分,涵盖了常用的生物信息学技能 。
Perl 的应用:介绍了计算机生物学中主要的程序语言: Perl. 及如何运用 Perl 语言编写研究所需的程序。对该语言的讲解浅显易懂,使读者能很快学会如何编写功能强大的程序,解决生物信息学的实际问题。
数据库的应用:重心从编写生物信息学程序转到如何开发能组织、储存、获取和处理数据的工具。运用编程技能产生各种各样的生物信息学数据库。作者推荐了几种常用的数据库,如蛋白质数据库: SWISS-PROT , EMBL 和 Genbank 。同时,也讨论了如何运用生物信息学数据库产生相互关联的数 据库系统。所有的例子中都应用了 MySQL 工具。
网络的应用:讨论了相关的网络技术,使生物信息学研究者可以将自己的研究发现和数据上传到网络上。
应用:该部分将重心从编写应用程序转到程序的应用上。讲解的程序包括: Clustal-W 、 EMBOSS 、 STRIDE 、 BLAST 和 Xmgrace. 。以讨论 ”the Bioperl project” 的重要性结束全书。
该书中而源代码,相关链接,勘误表和列出的内容可相关网站上找到 powerpoint 格式的版本。
针对对象:生物专业的本科生和研究生,需要对生物信息学有更多了解的生物学家,计算机科学家。
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