细胞和分子生物学 《Cell and Molecular Biology》

简评

    在细胞和分子生物学领域正不断有新的发现，你可能会感到还没来得及接受一个新观点，更新的观点就接踵而至。想要不被迷惑，最好的方法是不要去追究细节，而是围绕概念形成知识。如此，即使实践变化了，你仍能根据基本概念把变化轻易吸收到自己的理解中来。通过创造性思维，你可以增长解决问题的能力，可以适应新的环境，可以自己估计各种信息的价值。
    不同于一般的教材，本书在每一章都按照读者的学习过程分成几个部分：首先是“章节概要”，在你看完后，再看“要学习的目标”，如果认为自己都掌握了，浏览“关键词”，帮助你把握重点。接下来，如果你能顺利回答 “问题总结”，那你就牢固的掌握了这一章的内容。
    全书分18章：1，基本介绍2，生命的化学基础3，生物能学，酶和代谢4，血膜的结构和功能5，有氧呼吸和线粒体6，光合作用和叶绿体7，细胞和环境的互作8，细胞膜系统9，细胞骨架和细胞运动10，基因和基因组11，遗传信息表达12，细胞核及基因表达调控13，DNA复制和修复14，细胞增值15，细胞信号16，癌17，免疫应答18，细胞和分子生物学技术。

DNA修复方案 《DNA Repair Protocols》

简评
    本书是关于哺乳动物细胞的DNA损伤和修复的实验方法的。第3，4章是关于细胞遗传学分析的。第3章是从吸烟者或化疗病人身上取得血淋巴细胞，进行离子化或紫外照射，计算染色体的畸变率，间接反映了组成修复的缺陷；第4章报道了最近才注意到的现象，那就是有些被放射的细胞看似无损，可它的后代却表现出基因组的各种不稳定；第7章提出一种检测DNA双链破损的方法。利用特殊抗体，用免疫荧光在细胞水平就可检测到这种破损部位；第13，14章介绍了量化DNA损伤的方法，使用的是一种能增强荧光的超敏感的核酸染料－PicoGreen。用量化PCR结合Southern杂交的方法，可以测出线粒体或核基因组的DNA损伤度；第21章描述了估计DNA中单链缺刻水平的方法。单链缺刻间接由双链DNA降解的量来反应；第22章中，一种改进的磷32标记方法，成为了检测DNA中“加成”碱基的灵敏手段；第24章中，利用能形成单链缺刻的内切酶，人们可以做出错配修复质粒底物；第26章介绍了几种研究哺乳动物细胞中碱基切除修复机制的方法；第28到32章是关于DNA解旋酶在DNA修复中起到的核心作用。

离子通道 《Ion Channels》
简评
　　现在已知离子通道在细胞生物学和生理学中扮演重要角色，很多疾病究其起因就是离子通道的功能失调。应用现在的技术手段，研究者可以直接实时地检测离子通道活动，亚单位的化学计量，结构和功能的关系以及其它的生物物理和生化产量。本书详细描述了这些技术突破和实验思路。
　　全书分为四个部分。第一部分：细胞中离子通道的外生表达方法。1，人上皮钠离子通道的功能重组。2，利用复制短少病毒过表达神经元中的蛋白。3，利用基因枪使神经元中的蛋白外生表达。第二部分：研究离子通道结构功能的方法。1，钾离子通道电压门的三重和四重结构。2，利用爪蟾卵母细胞表达系统化学计量上皮钠离子通道的亚单位。3，荧光定量共振能量转移分析。第三部分：研究通道调节和生理功能的方法。1，探测离子通道中磷酸肌醇的作用。2，双面脂层中的钠离子通道。3，体内估计爪蟾卵母细胞离子通道密度的方法。4，电记录的脑皮质切片的准备。5，体内胞外记录神经元的静脉标记和化学表型。6，碳纤维安培法。第四部分：研究离子通道病，遗传筛查的方法。1，用钾离子吸收缺陷型大肠杆菌筛查细菌钾离子突变株的功能。2，心脏的离子通道病。3，组织特异性转基因和基因敲除小鼠。

基因表达数据的微阵列分析 《Analyzing Microarray Gene Expression Data》

简评　    

    近年来，分子生物学的研究方法得到了迅猛发展，其中一个重要代表就是DNA微阵列技术。DNA微阵列技术提供了同时分析成千上万个基因的方法。通过把生物学与统计学、数学、计算机、物理学等结合起来，微阵列技术帮助人们更深刻地认识基因调控和互作。
    对基因表达水平的实际测量包括实验的设计、图形处理、输出检测、数据转换和非线性化建模。微阵列实验产生的数据可看成由不同组织样品和基因为基准组成的表达水平的矩阵。微阵列数据分析的目的是在样品基因和它们表达水平之间建立联系。
    本书着重阐述对微阵列数据的分析方法，也兼顾了相关的生物学技术及对数据的标准化处理。第1章作为基本背景介绍，列举了微阵列相关的生物逻辑规律，回顾DNA、cDNA、寡核苷酸阵列的发展；第2章讲解如何对基因表达微阵列数据筛选和标准化；第3章设想在多维可变量环境中，该如何从这个混杂模型中提取数据；第4章延续上一章思路，具体到用EMMIX-GENE程序分析实际问题；第5章讲解如何从样品巨大的备选基因池中挑选合适的差异表达基因；第6章介绍对微阵列数据的区分分析原则；第7章则是区分分析原则的实际运用；第8章具体到在癌症研究中如何把对癌组织的数据分析与诊断结果和治疗方案联系起来。

分子生物学中的物理学 《Physics in Molecular Biology》
简评
    生物学常常涉及到很多其它基础学科。本书选择围绕基因的物理、生物、化学问题，关注的是数学建模方法。
    本书关于生物学的知识都用尽可能简单的语言介绍，而不追求精确和完整。而藏于这些生物学现象后的物理因素则详细完整地介绍。有些重大的生物物理学领域，有其它的书作专项介绍了，所以本书就避而不谈，如膜物理学和跨膜运输，神经元信号传导和感应器等。
    本书把注意力放在了基因、DNA、RNA、蛋白，尤其是这些东西是如何组成λ－噬菌体的功能系统，也列举了一些分子网络实例。第1章介绍生物学中的一些重要知识，这些知识要么在物理学中没有相呼应的，会妨碍一个物理学者理解，要么是太熟悉以至于没有机会去专门了解的；第2章介绍多聚体的物理学，强调能量和焓的互换，多聚物的形状受压力影响的改变；第3－5章介绍了最重要的生物多聚体：DNA、RNA、蛋白质。它们的稳定性是如何形成的。生物分子可用来进行各种类型的计算，如分子复制（PCR）；第4－6章介绍蛋白的折叠；第7章，一个蛋白如何控制另一个蛋白的产生。基因控制包括平衡统计机制和时间限度，并以大肠杆菌中的λ－噬菌体为实例；第8章继续基因表达和分子网络的话题，包括热休克机制。活细胞中蛋白折叠也是一个控制机制，RNAp的σ亚单位控制了基因更高层次的表达；第9章讨论进化，从最小尺度到最大尺度，随机和选择的互作。