-----Metagenomics：Methods and
Protocols
作者：Streit W.R.，Daniel R.
出版：科学出版社
索书号： Q933/M587s/2012/Y
元基因组或总体基因体学（Metagenomics）元基因组是与人类共生的全部微生物的基因总和，又被称为“微生物组”或“人类第二基因组”，是一门直接取得环境中所有遗传物质的研究。研究领域广泛，也可称为环境基因体学、生态基因体学或群落基因体学。在早期研究微生物基因体必须将环境基因DNA或RNA克隆进入大肠杆菌体内，利用复制选殖方式，分析在自然环境中复制选殖特定基因(通常为16S rRNA)的多样性。但是，以复制选殖的方式得不到精准的微生物多样性。近十年，研究学者利用DNA定序或焦磷酸定序的方式取得环境中所有样本基因，此新技术有助于我们取得微观下的生物多样性。总体基因体学提供一个更客观的方式发现微生物的世界，有可能改变之前我们所认知的微生物世界。元基因组学是在微生物基因组学的基础上发展起来的一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法，在开发微生物资源多样性、筛选获得新型活性物质、发掘与抗生素抗性、维生素合成及污染物降解相关的蛋白质等方面展示了很大的潜力。
斯特赖特 W.R.和丹尼尔 R.所著的这本《元基因组学——方法和步骤(影印版)》一书于2012年由科学出版社出版，为“生命科学实验指南系列”丛书之一，内容包括了元基因文库的构建,元基组文库的筛选技术以及针对不同活性目标产物的筛选方法, 该书适合于从事环境微生物学、微生物生态学等相关专业的高年级本科生、研究生，以及相关研究工作者等参考使用，同时可以帮助希望从事元基因组学研究的科技人员尽快建立相关的实验平台。《元基因组学：方法和步骤(影印版)》脉络清晰，为每一个想要了解元基因组学的人员提供了有条理、有层次的知识引入，是一本值得阅读的元基因组学教程。
《元基因组学——方法和步骤(影印版)》提供了各实验室通用的基本方法的综述和简介，为微生物元基因组学提供了有力证据。为了给那些在自己的实验室建立元基因组学研究的对元基因组有兴趣的人提供帮助，本书所有章节都有该领域的科研工作者编写。在这本书中，我们试着罗列本领域内各种工作方式：从土壤和海洋样本中分离样本DNA开始构建和筛选文库，最终我们提供了一些可以用来筛选大片段的生物信息学工具的建议。《元基因组学：方法和步骤（影印版）》共有23章，第1章至第4章介绍了如何从环境样本中分离DNA，主要讲解了当前用于构建元基因组文库的策略。第5章至第8章描述了有关不同宿主系的元基因组文库表达的实验步骤，其中包括广谱宿主载体文库构建的简单步骤和操作硫化裂片菌作为宿主细胞的的复杂步骤。此外，本书利用大量章节介绍用于鉴定依赖功能和序列的不同的酶或其他生物分子的筛选策略。总之，本书有15个章节介绍了广泛的元基因组文库筛选方式，为在各种微生物实验中筛选筛选大量生物催化剂提供了可用的方法。
《元基因组学：方法和步骤（影印版）》一书作为元基因组学应用方面读物，内容饱满详实，语言浅显易懂，书中配备大量插图，便于读者理解概念及过程。此外，在排版过程中也很有逻辑，使读者在阅读过程中思路更加清晰。在本书的最后，将出现的相关词汇都罗列出来，并标注页码，便于读者查找相关内容，减少因目录不明确造成的阅读不便等问题。
总的说来，《元基因组学：方法和步骤（影印版）》一书为想要了解元基因组学的人员提供了清晰的导读路径，作为元基因组学应用领域的读物，是一本值得为想要涉足该领域的人员推荐的专业书籍。
本书目录：
前言
编著者
第一章 分子的方法来研究复杂的微生物群落
第二章 Small-Inert和Large-Inert元基因组文库的构建
第三章 海洋元基因组文库的构建和筛选
第四章 元基因组分析同位素富集DNA
第五章 广泛的宿主范围克隆功能元基因组
第六章 革兰氏阳性宿主变铅青链霉菌的克隆和表达
第七章 极端嗜热古菌硫磺矿硫化叶菌中异种基因的表达
第八章 元基因组DNA功能性表达的新工具
第九章 元基因组DNA功能性启动子的筛选在So-Roun表达系统中的实际应用
第十章 筛选底物诱导的基因表达：一种元基因组文库高通量筛选的方法
第十一章 筛选有活性和立体选择性的水解酶
第十二章 筛选元基因组文库中编码纤维素酶的克隆
第十三章 筛选元基因组文库中的漆酶活性
第十四章 筛选依赖N-AHSL信号的干扰酶
第十五章 氯代化合物污染位点的生物修复后分子marken的鉴定
第十六章 从复杂的微生物群落中分离编码新型PHB循环的酶基因的方法
第十七章 鉴定和分离海绵体中微生物群落中生物活性天然产物的元基因组学途径
第十八章 新型抗生素抗性基因的筛选
第十九章 微生物菌落中的新型金属抗性基因：一种功能元基因组学途径
第二十章 利用减法杂交磁珠捕获全长功能基因的检索
第二十一章 元基因组文库中选择的目的基因的检测和分离
第二十二章 筛选元基因组文库克隆中DNA微阵列的应用
第二十三章 MetaGenome Threader：元基因组计划中预测基因的DNA序列的软件工具
索引
（武汉大学生命科学学院研究生 刘靖）