Protein-protein interactions in drug discovery

新药发现中的蛋白质——蛋白质的相互作用

 

    者:Alexander DÖmling

 

社:WILEY-VCH

号:Q51/P967ad/2013/Y

藏书地点:武大外教中心

 

许多生命活动是以蛋白质分子的结合和解离来实现的,细胞的各种重要生理活动,细胞对外界环境及内环境作用的反应等,均是以蛋白质间相互作用为纽带,形成信号转导网络系统。因此,对蛋白质相互作用的深入研究是认识和理解各种生命现象的必要前提。蛋白质之间的相互作用在细胞生物学水平上起着十分关键的作用:(1)遗传上的功能常常与相应的蛋白质间相互作用有关;(2)在信号传递途径中也需要蛋白质的相互作用;(3)蛋白酶——蛋白质底物间的相互作用与生物的催化反应密切相关;(4)蛋白质的相互作用对于整合如RNA多聚酶或对多成分酶促反应也有至关重要的影响。可见,细胞的代谢、信号传到以及基因表达调控都与蛋白质的功能密切相关,蛋白质与其他生物大分子一样,必须参与到错综复杂的相互作用网络中行使其功能,这也是目前所有生物学研究的基础。蛋白质的相互作用能产生许多效应,如改变蛋白质的动力学,形成特异底物作用通道,生成新的结合位点,使蛋白质失活,改变蛋白质对其作用底物的专一性等。了解蛋白质相互作用的方式、作用程度、作用结果,将有助于解决蛋白质功能的分析、生命发育的探索、疑难病理的研究、有效药物的开发等众多问题。目前,大量基因及其产物的结构和功能的信息、基因间相互作用的信息、基因调控的信息以及分子进化的信息都不断地涌现出来,为研制新药提供了丰富的信息。

本书共由十二章内容构成,第一章是对蛋白质——蛋白质相互租用(PPI)的一个概述,PPI在人类生理中的角色、PPI的调控、PPI界面的结构特征、PPI抑制子的鉴定等内容都涵盖其中。第二章阐述了蛋白质——蛋白质相互作用的预测可以促进系统生物学的研究,包括疾病和药物发现的相互作用组的相关性、目前基于实验的相互作用组知识的不完整性、从实验得到的相互作用的可靠度等多个方面的内容。第三章的主题是蛋白质——蛋白质相互作用的调节者,主要从三维的重要性这一方面进行描述。作者在第四章介绍给读者的是关于蛋白质相互作用抑制子的一个猜测,涉及了相互作用的类型、界面的特征、蛋白质相互作用抑制子化学空间的猜测等内容。第五章介绍的是用已知化学锚定残基的杠杆作用来破坏蛋白质相互作用的已知化学锚定残基的交互技术,蛋白质相互作用中的可用作药物的位点、基于结构的文库涉及、虚拟筛选等都是本章要阐述的内容。第六章对SH3作为药物靶点进行了详细的描述。第七章的主题是P53/MDM2拮抗剂,包括许多共晶体结构对p53/MDM2蛋白质相互作用的特征描述、Nutlins这一个首创的MDM2拮抗物新药等几个方面。第八章对LFA-1/ICAM相互作用的抑制用于自身免疫疾病的治疗。第九章介绍的主要内容是AGC激酶的PIF袋,它是别构调节剂及蛋白质相互作用抑制子的一个靶标位点,PIF口袋的发现和生理功能、PIF口袋和药物发展相关的性质、天然的HM多肽配合基的分子相互作用等内容都涵盖其中。第十章对酮病和Epelsiban进行了介绍,它是一种有效可选择的口服催产素受体阻断药。第十一章阐述的是用于细胞粘附受体的蛋白质——蛋白质相互作用的肽抑制剂:RGD肽及其他,包括从FNRGD基序的发现到第一个选择性的周期的RGD多肽、RGD的序列、整合蛋白及受体选择性等多个方面。第十二章对用于生产非ATP竞争的细胞周期蛋白激酶抑制剂的REPLACE策略进行了详细的阐述。

蛋白质与蛋白质之间相互作用构成了细胞生化反应网络的一个重要组成部分,蛋白质——蛋白质相互作用网络对调控细胞及其信号有重要意义。本书作者共通过十二章的内容,对药物发现中蛋白质——蛋白质相互作用的研究进行了详细的描述,内容针对性比较强,因此本书比较适合从事蛋白质相互作用相关研究的生命科学、医学、药物学等科研工作者及学生阅读参考。

 

本书目录

贡献者名单

前言

个人序言

第一章    蛋白质——蛋白质相互作用:概述

第二章    蛋白质内和蛋白质间相互作用的预测促进系统生物学的研究

第三章    蛋白质——蛋白质相互作用的调节者:三维的重要性

第四章    蛋白质——蛋白质相互作用抑制子的一个猜测

第五章    用已知化学锚定残基的杠杆作用来破坏蛋白质相互作用的已知化学锚定残基的交互技术

第六章    SH3作为药物靶点

第七章    P53/MDM2拮抗剂:朝向毒性抗癌治疗

第八章    LFA-1/ICAM相互作用的抑制用于自身免疫疾病的治疗

第九章    AGC激酶的PIF袋:别构调节剂及蛋白质相互作用抑制子的一个靶标位点

第十章    酮病和Epelsiban:有效可选择的口服催产素受体阻断药

第十一章 用于细胞粘附受体的蛋白质——蛋白质相互作用的肽抑制剂:RGD肽及其他

第十二章 用于生产非ATP竞争的细胞周期蛋白激酶抑制剂的REPLACE策略

索引

(郑银珍)